Pán Ježiš Kristus varoval svojich učeníkov a apoštolov, že budú vo svete prenasledovaní. Na tieto udalosti nemuseli dlho čakať - už v druhej polovici prvého storočia začali rímske úrady aktívne aktivity venované prenasledovaniu stúpencov kresťanskej viery.
Kresťania začali prenasledovanie znášať bezprostredne po Kristovom nanebovstúpení. Tieto udalosti sú opísané v Svätom písme Nového zákona. Hlavnými prenasledovateľmi boli najskôr Židia, až potom rímske úrady.
Prvým rímskym cisárom, ktorý prenasledoval kresťanov, bol Nero. Bol iniciátorom upálenia Ríma a vina padla na Kristových nasledovníkov. Kresťania boli povolaní nielen za odpadlíkov od pohanského náboženstva, ale aj za škodlivých členov rímskej spoločnosti, kvôli ktorým došlo k hrozným následkom požiaru, ktorý zničil niekoľko veľkých oblastí Ríma. Kresťania sa teda považovali za odporcov štátneho a náboženského systému Rímskej ríše.
Ďalej sa historicky kresťania pripisovali aj iným „hriechom“proti spoločnosti, pohanstvu a úradom. V stúpencoch Kristovho učenia teda pohania videli strašných kanibalov, ktorí sa údajne zhromažďovali v jaskyniach, aby sa napili krvi detí. Korene tohto presvedčenia spočívajú v skutočnosti, že kresťania z prvých storočí pochopili potrebu sviatosti tela a krvi Kristovej. Kresťanom tiež vyčítali rôzne skazené orgie, nepochopiteľné obete, ktoré priniesli svojmu Bohu.
V čase prenasledovania kresťanov za vlády cisára Traiana (98 - 117 rokov vlády) sa objavuje nová príčina prenasledovania. Jeden z najstrašnejších a nevysvetliteľných. Takzvané prenasledovanie nomen ipsum, čo v preklade z latinčiny znamená - „iba pre meno“. Na popravu stačilo označiť sa za kresťana. Pod cisárom boli určité orgány, ktoré vyhľadávali kresťanov za účelom následného mučenia.
Jedným z hlavných dôvodov prenasledovania je odmietnutie kresťanov prinášať obete pohanským bohom. Každý rímsky cisár-prenasledovateľ mal právo popraviť za toto „zverstvo“. Práve kvôli tomu mnoho vynikajúcich cirkevných vodcov v prvých storočiach utrpelo až k smrti.
Prenasledovanie kresťanov v Rímskej ríši pokračovalo vo vlnách, až sa kresťanstvo stalo štátnym náboženstvom za vlády cisára Konštantína Veľkého (Milánsky edikt z roku 313 bol hlavným krokom k následnej formácii kresťanstva ako štátneho náboženstva Ríma). Treba si však uvedomiť, že aj po Konštantínovi sa objavili cisári, ktorí mohli prenasledovať kresťanov za to, že sa odmietli vrátiť k pohanskému náboženstvu.
